ಸುದ್ದಿ: ಬಯೋ ಎಮು (BioEmu) ಎಂಬ ಹೊಸ ಡೀಪ್ ಲರ್ನಿಂಗ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯು ಜೈವಿಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ವಾಭಾವಿಕವಾಗಿ ಅನ್ವೇಷಿಸುವ ಆಕಾರಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ಊಹಿಸುತ್ತದೆ.

ಮುಖ್ಯಾಂಶಗಳು:

• ಬಯೋ ಎಮು ಎಂದರೇನು?: ಇದು ಜೈವಿಕ ಅಣು ಎಮ್ಯುಲೇಟರ್ (ಬಯೋಮಾಲಿಕ್ಯುಲರ್ ಎಮುಲೇಟರ್) ಬಯೋ ಎಮು ಎಂದು ಹೆಸರಿಸಲಾದ ಒಂದು ಉತ್ಪಾದಕ ಡೀಪ್ ಲರ್ನಿಂಗ್ ವ್ಯವಸ್ಥೆಯಾಗಿದ್ದು, ಜೈವಿಕ ಪರಿಸ್ಥಿತಿಗಳಲ್ಲಿ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಕಾರಗಳ ಸಂಪೂರ್ಣ ವ್ಯಾಪ್ತಿಯನ್ನು ಊಹಿಸುತ್ತದೆ.
• ಅಭಿವೃದ್ಧಿಪಡಿಸಿದವರು: ಮೈಕ್ರೋಸಾಫ್ಟ್, ರೈಸ್ ವಿಶ್ವವಿದ್ಯಾಲಯ (USA), ಮತ್ತು ಫ್ರೀ ಯೂನಿವರ್ಸಿಟಿ (ಜರ್ಮನಿ).
• ಪ್ರಮುಖ ಸಾಮರ್ಥ್ಯಗಳು:
  • ಅಮೈನೋ ಆಮ್ಲ ಅನುಕ್ರಮಗಳಿಂದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ರಚನೆಗಳ ಸಮತೋಲನ ವಿತರಣೆಯನ್ನು ಮಾದರಿ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
  • ಒಂದೇ GPU ಬಳಸಿ ಗಂಟೆಗೆ ಸಾವಿರಾರು ಪ್ರೋಟೀನ್ ಆಕಾರಗಳನ್ನು (ಕನ್ಫರ್ಮೇಶನ್‌ಗಳನ್ನು) ಉತ್ಪಾದಿಸುತ್ತದೆ.
  • ಹೆಚ್ಚಿನ ಉನ್ನತ ಗುಣಮಟ್ಟದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಹೊಂದಾಣಿಕೆ ಮಾದರಿಯನ್ನು ದೊಡ್ಡ ಪ್ರಮಾಣದಲ್ಲಿ ಸಕ್ರಿಯಗೊಳಿಸುತ್ತದೆ.
• ಸಾಂಪ್ರದಾಯಿಕ ವಿಧಾನಗಳ ಮೇಲಿನ ಅನುಕೂಲಗಳು:
  • ಆಣ್ವಿಕ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ (Molecular dynamics) ಸಿಮ್ಯುಲೇಶನ್‌ಗಳಿಗಿಂತ ವೇಗವಾಗಿದೆ ಮತ್ತು ಹೆಚ್ಚು ವೆಚ್ಚ-ಪರಿಣಾಮಕಾರಿಯಾಗಿದೆ.
  • ಔಷಧ ವಿನ್ಯಾಸಕ್ಕೆ ಸಂಬಂಧಿಸಿದಂತೆ, ಇದು ದೊಡ್ಡ ಆಕಾರದ ಬದಲಾವಣೆಗಳು, ಸ್ಥಳೀಯವಾಗಿ ಜರಗುವ ಹೊರಳಿಕೆಗಳು ಹಾಗೂ ತಾತ್ಕಾಲಿಕವಾಗಿ ಕಾಣಿಸಬಹುದಾದ ಗುಪ್ತ ಜೇಬುಗಳನ್ನು ನಿಖರವಾಗಿ ಪತ್ತೆಹಚ್ಚುತ್ತದೆ.
  • ದೊಡ್ಡ ರಚನಾತ್ಮಕ ಬದಲಾವಣೆಗಳಲ್ಲಿ 83% ಮತ್ತು ಸಣ್ಣ ಬದಲಾವಣೆಗಳಲ್ಲಿ 70-81% ಅನ್ನು ನಿಖರವಾಗಿ ಊಹಿಸುತ್ತದೆ.
• ಅನ್ವಯಿಕೆಯ ಪ್ರಮುಖ ಅಂಶಗಳು:
  • ಅಡಿನೈಲೇಟ್ ಕಿನೇಸ್ (adenylate kinase) ಎಂಬ ಎಂಜೈಮ್‌ಗಳ ಹಲವಾರು ರೂಪಗಳನ್ನು (ತೆರೆದ/ಮುಚ್ಚಿದ) ಭವಿಷ್ಯ ನಿರ್ದೇಶಿಸುತ್ತದೆ..
  • ಆಂತರಿಕವಾಗಿ ಅಸ್ತವ್ಯಸ್ತವಾಗಿರುವ ಪ್ರೋಟೀನ್‌ಗಳ ಮೇಲೆ (ಯಾವುದೇ ಸ್ಥಿರ 3D ರಚನೆ ಇಲ್ಲ) ಕಾರ್ಯನಿರ್ವಹಿಸುತ್ತದೆ.
  • ಪ್ರೋಟೀನ್ ಸ್ಥಿರತೆಯ ಮೇಲೆ ರೂಪಾಂತರದ ಪರಿಣಾಮಗಳನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ಸಹಾಯ ಮಾಡುತ್ತದೆ.
• ಮಿತಿಗಳು:
  • ಔಷಧ ಅಣುಗಳು, pH/ತಾಪಮಾನ ಬದಲಾವಣೆಗಳು, ಒಳಚರ್ಮ/ಪದರಗಳು(membranes) ಅಥವಾ ಜೀವಕೋಶದ ಪರಿಸರಗಳನ್ನು ಮಾದರಿ ಮಾಡಲು ಸಾಧ್ಯವಿಲ್ಲ.
  • ಆಲ್ಫಾಫೋಲ್ಡ್‌ನಂತಹ ಅನುಮಾನಿತ ಅಂದಾಜು ಅಂದಾಜಿನ ಸಾಮರ್ಥ್ಯ ಇದಕ್ಕಿಲ್ಲ.

ಮಹತ್ವ: ಬಯೋ ಎಮು ಔಷಧ ಆವಿಷ್ಕಾರ ಮತ್ತು ಜೈವಿಕ ತಂತ್ರಜ್ಞಾನಕ್ಕೆ ನಿರ್ಣಾಯಕವಾದ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಡೈನಾಮಿಕ್ಸ್ ಅನ್ನು ಅರ್ಥಮಾಡಿಕೊಳ್ಳಲು ವೇಗವಾದ, ಅಳೆಯಬಹುದಾದ ಮತ್ತು ಹೊಂದಿಕೊಳ್ಳುವ ವಿಧಾನವನ್ನು ಒದಗಿಸುವ ಮೂಲಕ ಪ್ರೋಟೀನ್ ಮಾದರಿಯಲ್ಲಿ ಕ್ರಾಂತಿಯನ್ನುಂಟುಮಾಡುತ್ತದೆ.